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輸入疾病信息即可生成靶點?AIGP大模型平臺發布

文章來源:科技日報  發布時間: 2023-03-27 11:16:03  責任編輯:cfenews.com
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(相關資料圖)

“輸入病人疾病相關的多組學數據,如胃癌病人,AIGP平臺即能夠分析其多組學數據,找到針對這個胃癌病人的靶點,根據這個靶點生成一個抗體甚至一系列有多樣性的蛋白。最后,一鍵式生成的蛋白回到自動實驗室里合成蛋白。”3月23日,在百圖生科基于生命科學大模型驅動的AIGP平臺發布會上,百圖生科CTO 宋樂說。

宋樂在介紹AIGP平臺。 主辦方供圖。

宋樂介紹,上面所說的只是AIGP平臺其中一個功能,其還可以根據形狀及理化性質(物理性質和化學性質)需求,生成一系列滿足需求的蛋白。再就是根據一個蛋白質靶點生成對應和靶點結合的蛋白,比如針對新冠病毒生成一個蛋白,甚至針對石油相關的分子生成一個酶。

據了解,過去兩年多,百圖生科構建了生命科學領域千億參數的跨模態大模型“xTrimo”。該大模型從跨物種、跨模態的生命信息中學習蛋白質如何構成和實現功能、如何相互作用、如何組合和調控細胞功能的關鍵規律,從而破解生命的自然語言 —— 蛋白質。基于大模型,AI在一系列任務算法上取得了明顯進展,除了更好地完成結構預測等基礎任務外,也開始可以根據不同的問題輸入,以生成的方式,設計創新的蛋白質,來回答各種生命科學問題。

目前,平臺設置了3類功能模塊,分別是Function to Protein Design(F2P,根據結構、功能、可開發性等功能指標設計/優化蛋白質)、Protein to Protein Design(P2P,給定抗原等目標蛋白,設計與之以特定方式結合的抗體等蛋白質),以及Cell to Protein Design(C2P,給定細胞,發現調控細胞功能的靶點蛋白并設計相應的調控蛋白)。

宋樂表示,此次平臺的發布,旨在將這一技術平臺的能力與更多行業人士分享,利用AI設計創新蛋白質的能力,共同研發更多的前沿藥物和其他生命科學項目,也通過一系列挑戰性的新任務,驅動AIGP平臺的技術進步。此前,AIGP平臺已經進行了一段時間的內部測試,在創新免疫調控藥物ImmuBot的研發中,貢獻了多個高性能彈頭、新功能傳感器的研發案例。

中國科學院院士、著名免疫學家董晨教授認為:“AI能夠解決的問題,就是對大數據的分析和進一步的演繹和應用。在當下的時間節點,AIGP確實是一個呼之欲出的平臺。相信AIGP對于我們理解蛋白質,以及在生物系統中研究和發現它的功能和調控,乃至于將來研發新藥,都會有非常大的作用。”

百圖生科CEO劉維表示,雖然當前AI大模型和與之配套的大規模數據圖譜、高通量驗證體系都遠不完美,但已經凝結了很多前沿技術的創新和探索,接下來,從開始展露一些能力到提高它的泛化能力和速度,需要更多專業人士的加入,以實現前沿項目的加速研發。

宋樂也表示,當前,根據不同模塊的輸入和要求,AIGP平臺可在較短時間內設計和生成具有特定性質的蛋白質。今年6月起,部分功能模塊將進一步開放,讓專業用戶可以直接自主使用,在更多的研究場景調用AI的蛋白質生成能力,激發更多的生命科學探索。

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